科研菌株是一種菌類系列中一個品種，又叫品系，表示同種微生物不同來源的純種培養，從自然界中分離得到的每一個微生物純培養都可稱一個菌株。
對微生物領域來說，掌握標準菌株的管理是重中之重，它的作用體現在規范微生物實驗室用于實驗質量控制和操作評估，保障實驗結果可靠及人員和環境安全。目的對微生物標準菌株的購買、驗收、復活、確認、傳代、保存、使用、銷毀等進行規定，確保標準菌株符合要求，保證檢測結果，使菌株管理規范化。適用于微生物實驗室所有的菌株管理。產生不符合項所體現的原因很多，而產生問題主要原因表現在：
(1)實驗人員對標準菌株的基礎知識薄弱，自身意識上也不重視；
(2)實驗室相關的內部培訓少，技能動手操作少；
(3)實驗監督人員監督力度不足，不能充分發揮把關的作用。
根據上面提到的三點因素，易導致以下問題的出現：
1、標準菌株購買不當，易混淆標準菌株與質控菌株，或者缺少標準菌株的檢測證書，無法溯源。在面對這次情況時，應先理清標準菌株的概念，清晰標準菌株的采購渠道。每支菌株必須要有可溯源的材料。
2、標準菌株的標識信息不夠全面，漏基本信息，導致記錄追溯不清晰。標識內容應包含菌株名稱、編號、傳代次數、傳代時間、傳代人。
3、保存菌株的傳代周期跟不上，易導致2-8℃保存的菌株或常溫存放的菌株出現老化、變異、污染等情況，造成菌株的保存與使用不當。產生的主要原因是菌株管理人員對菌株的管理基礎弱，不清楚菌株的要求。副溶血性弧菌、銅綠假單胞菌等在室溫下儲存，其余菌株在2-8℃的冰箱儲存，儲存期限為3個月。必須在三個月內進行工作菌株的轉接傳代。工作菌種傳代次數不能超過五代。
4、菌株銷毀不及時，實際工作與銷毀記錄對不上，高壓滅菌時要用化學指膠帶對滅菌效果進行驗證，確保菌株已失活。這需要檢驗人員在意識上對菌株的規范操作引起重視。
5、標準菌株的期間核查不到位，核查的菌株較少，無法實際監測到實際使用時的菌株。本公司采用的標準菌株期間核查的方法：從-80攝氏度冰箱中取出標準儲備菌株在40℃的水中溶解，迅速倒入配好的已滅菌的液體培養基中，在適宜的溫度下培養，24h后劃線分離。將長出的菌落用生化鑒定儀或生化鑒定管進行鑒定。期間核查的頻率：每半年對使用標準菌株進行一次期間核查。
