結(jié)核桿菌(TB)熒光PCR核酸擴(kuò)增檢測試劑盒說明書

【產(chǎn)品名稱】

通用名稱：結(jié)核桿菌(TB)核酸檢測試劑盒(熒光-PCR法)

Name  ：Tubercle Bacillus Detection Kit (Real-Time PCR Method)

【包裝規(guī)格】48T/盒

【預(yù)期用途】

4.1結(jié)核病是由結(jié)核桿菌（Tubercle bacillus， TB）引起的傳染性疾病，可累及全身多個(gè)器官，但以肺結(jié)核為常見。據(jù)世界衛(wèi)生組織報(bào)道，*有超過三分之一的人口被致病菌結(jié)核分枝桿菌所感染，其中約10%的人們在其有生之間將面臨活動(dòng)性結(jié)核病的困擾[1]。而在這些結(jié)核病患者中，每年有200萬人喪生。雖然有抗菌藥物，但其療程至少要6個(gè)月，且花費(fèi)巨大，由于經(jīng)濟(jì)等原因而常常使患者無以為繼[2]。本試劑盒適用于檢測人氣管分泌物拭子、肺組織等樣本中的結(jié)核桿菌，用于結(jié)核桿菌感染的輔助診斷。

【檢驗(yàn)原理】

本試劑盒采用TaqMan探針法實(shí)時(shí)熒光PCR技術(shù)，設(shè)計(jì)一對結(jié)核桿菌特異性引物，結(jié)合一條特異性探針，用熒光PCR技術(shù)對結(jié)核桿菌的核酸進(jìn)行體外擴(kuò)增檢測，用于臨床上對可疑感染者的病原學(xué)診斷。

【試劑組成】

名      稱   規(guī)      格

核酸提取液           1.5mL×2管

酶液        50μL×1管

TB反應(yīng)液       1.0mL×1管

TB陽性質(zhì)控品       50μL×1管

陰性質(zhì)控品      250μL×1管

注：

1）不同批號(hào)試劑不能混用。

2）試劑盒內(nèi)各試劑組份足夠包裝規(guī)格所標(biāo)示的檢測次數(shù)。

【儲(chǔ)存條件及有效期】

-20℃±5℃，避光保存、運(yùn)輸、反復(fù)凍融次數(shù)不超過5次，有效期12個(gè)月。

【適用儀器】

ABI 、安捷倫MX3000P/3005P、LightCycler、Bio-Rad、eppendorf等系列熒光定量PCR檢測儀。

【標(biāo)本采集】

    無菌采集人肺病變部位或病變/非病變部位交界處的樣品；或用滅菌棉拭子沾取人氣管分泌物，放入無菌試管中。

【保存和運(yùn)輸】

上述標(biāo)本短期內(nèi)可保存于-20℃，長期保存可置-70℃，但不能超過6個(gè)月，標(biāo)本運(yùn)送應(yīng)采用2~8℃冰袋運(yùn)輸，嚴(yán)禁反復(fù)凍融。

【使用方法】

1.樣品處理（樣本處理區(qū)）

1.1樣本前處理

組織樣品：每份組織分別從3個(gè)不同的位置稱取樣品約1g，手術(shù)剪剪碎混勻后取0.5g于研磨器中研磨，加入1.5mL生理鹽水后繼續(xù)研磨，待勻漿后轉(zhuǎn)至1.5mL滅菌離心管中，8000rpm離心2min，取上清液100μL于1.5mL滅菌離心管中；氣管分泌物取100μL提取。

1.2DNA提取

1)對上述處理好的標(biāo)本加入等體積核酸提取液（固體標(biāo)本加入50μL核酸提取液），100℃恒溫處理10min，13,000 rpm離心5min，取上清液轉(zhuǎn)移至新的1.5mL EP管，-20℃保存；

2)DNA的提取也可以采用上海晅科生物科技股份有限公司生產(chǎn)的DNA提取試劑盒（離心柱提取法），請嚴(yán)格按照試劑盒說明書進(jìn)行操作。

2.試劑配制（試劑準(zhǔn)備區(qū)）

根據(jù)待檢測樣本總數(shù)，設(shè)所需要的PCR反應(yīng)管管數(shù)為N(N=樣本數(shù)+1管陰性對照+1管陽性對照；樣品每滿7份，多配制1份)，每測試反應(yīng)體系配制如下表：

試劑 TB反應(yīng)液 酶液

用量（樣本數(shù)為N） 20μL 1μL

將混合好的測試反應(yīng)液分裝到PCR反應(yīng)管中，21uL/管。

3.加樣（樣本處理區(qū)）

將步驟1提取的DNA、陽性質(zhì)控品、陰性質(zhì)控品各取4μL，分別加入相應(yīng)的反應(yīng)管中，蓋好管蓋，混勻，短暫離心。

4.PCR擴(kuò)增（核酸擴(kuò)增區(qū)）

4.2將待檢測反應(yīng)管置于熒光定量PCR儀反應(yīng)槽內(nèi)；

4.3設(shè)置好通道、樣品信息，反應(yīng)體系設(shè)置為25μL；

熒光通道選擇： 檢測通道（Reporter Dye）FAM， 淬滅通道（Quencher Dye）NONE，ABI系列儀器請勿選擇ROX參比熒光，選擇None即可。

4.4推薦循環(huán)參數(shù)設(shè)置：

步驟 循環(huán)數(shù) 溫度 時(shí)間 收集熒光信號(hào)

1 1 cycle 95℃ 10min 否

2 40 cycles 94℃ 15sec 否

55℃ 30sec 是

5.結(jié)果分析判定

5.1結(jié)果分析條件設(shè)定

設(shè)置Baseline和Threshold：一般直接按機(jī)器自動(dòng)分析的結(jié)果分析，當(dāng)曲線出現(xiàn)整體傾斜時(shí)，根據(jù)分析后圖像調(diào)節(jié)Baseline的start值(一般可在3~15范圍內(nèi)調(diào)節(jié))、stop值(一般可在5~20范圍內(nèi)調(diào)節(jié))，以及Threshold的Value值(上下拖動(dòng)閾值線至高于陰性對照)，重新分析結(jié)果。

5.2結(jié)果判斷

陽性：檢測通道Ct值≤35.0，且明顯的擴(kuò)增曲線。

可疑：檢測通道Ct值>35.0，且出現(xiàn)明顯曲線的樣本建議重復(fù)試驗(yàn)，重復(fù)試驗(yàn)結(jié)果如果同樣出現(xiàn)Ct值≤35.0和明顯擴(kuò)增曲線則為陽性，否則為陰性。

陰性：樣本檢測結(jié)果無Ct值且無明顯的擴(kuò)增曲線。

6. 檢測方法的局限性

1）樣本檢測結(jié)果與樣本收集、處理、運(yùn)送以及保存質(zhì)量有關(guān)；

2）樣本提取過程中沒有控制好交叉污染，會(huì)出現(xiàn)假陽性結(jié)果；

3）陽性對照、擴(kuò)增產(chǎn)物泄漏，會(huì)導(dǎo)致假陽性結(jié)果；

4）病原體在流行過程中基因突變、重組，會(huì)導(dǎo)致假陰性結(jié)果；

5）不同的提取方法存在提取效率差異，會(huì)導(dǎo)致假陰性結(jié)果；

6）試劑運(yùn)輸，保存不當(dāng)或試劑配制不準(zhǔn)確引起的試劑檢測效能下降，出現(xiàn)假陰性或定量檢測不準(zhǔn)確的結(jié)果；

7）本檢測結(jié)果僅供參考，如須確診請結(jié)合臨床癥狀以及其他檢測手段。

7.質(zhì)控標(biāo)準(zhǔn)

陰性質(zhì)控品：無明顯擴(kuò)增曲線或無Ct值顯示；

陽性質(zhì)控品：擴(kuò)增曲線有明顯指數(shù)生長期，且Ct值≤32；

以上條件應(yīng)同時(shí)滿足，否則實(shí)驗(yàn)視為無效。

【注意事項(xiàng)】

1.所有操作嚴(yán)格按照說明書進(jìn)行；

2.試劑盒內(nèi)各種組分使用前應(yīng)自然融化，*混勻并短暫離心；

3.反應(yīng)液應(yīng)避光保存；

4.反應(yīng)中盡量避免氣泡存在，管蓋需蓋緊；

5.使用一次性吸頭、一次性手套和各區(qū)工作服；

6.樣本處理、試劑配制、加樣需在不同區(qū)進(jìn)行，以免交叉污染；

7.實(shí)驗(yàn)完畢后用 10%次氯酸或 75%酒精或紫外燈處理工作臺(tái)和移液器；

8.試劑盒里所有物品應(yīng)視為污染物對待，并按照《微生物生物醫(yī)學(xué)實(shí)驗(yàn)室生物安全通則》進(jìn)行處理。

【參考文獻(xiàn)】

Ø[1] Anon, W. H. O. (2006). Global Tuberculosis Control, Surveillance, Planning, Financing. Geneva: WHO, 1-242.

Ø[2] Russell, D. G. (2007). Who puts the tubercle in tuberculosis? Nat Rev Microbiol 5, 39-47.

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